Может ли другое лицо перевести на расчетный счет ФЛП денежные средства за продукцию, приобретенную ПФ на ID.

Да. При этом, в случае, если ПФ является ИП, необходим договор переуступки требования между лицом, оплачивающим счет, ПФ и ФЛП.